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2024年11月10日,由中国计算机学会主办的“2024物博会专题活动—第15届CCF太湖论坛—自主可控人工智能创新技术大会暨2024山水东路科创谷对话”在我市隆重召开。
在本次会议中,国家超级计算无锡中心副主任赵文来发表了主旨演讲《异构众核架构计算芯片加速大模型落地》。他表示,异构众核架构在运行效率上的纸面数据领先,且在实际应用中,由于架构的差异,众核的实际效率相较于传统的x86+GPU组合表现出更大的优势同时,对于实时推理和跨学科协作研究,对并行计算能力和灵活云端算力的需求也在不断增加。因此,异构集群和算力基础设施建设已经成为推动科技发展进步不可或缺的基础支撑。
此外,神威数智(无锡)科技有限公司联合国家超算无锡中心发布了业界首个对标DeepMind发布的AlphaFold3的国产大模型—SWBind。SWBind在常规的小分子配体、核酸分子(包括DNA和RNA)以及蛋白质的结构预测精度上能与AlphaFold3相媲美,并在模型置信度上达标。当前应用已正式发布并进入公测试用阶段,为用户提供了充分的机会来测试模型的性能,评估其在实际研究中的适用性和价值,截至目前,已获得数十家国内院校、研究院所的密切关注并反馈良好。
SWBind是国内首个成功复现AlphaFold3的成果,其性能与AlphaFold3相媲美。SWBind可以对蛋白质、DNA、RNA等大分子及小分子进行建模,并模拟其化学修饰。通过扩散方法,模型从原子噪声图像逐步降噪,最终生成分子结构的3D坐标,从而实现对分子结构的精准预测。SWBind采用成对残基关系编码器,处理成对表示和单一表示,大幅提升了对复杂生物分子相互作用的建模能力。
SWBind 应用模式场景
学术界的应用——蛋白质结构预测:
研究人员可使用SWBIND模型对已知和未知的蛋白质序列进行结构预测,验证模型的准确性和可靠性;药物靶点筛选:通过预测蛋白质与小分子化合物的结合模式,研究人员可以快速筛选出潜在的药物靶点,加速新药研发过程;疾病机理研究:了解特定蛋白质的结构有助于揭示疾病的发病机制,为疾病的预防和治疗提供理论依据。例如,阿尔茨海默病的发生与β-淀粉样蛋白的异常聚集有关,通过预测该蛋白的结构,可以为开发治疗阿尔茨海默病的药物提供重要的线索。
神威数智依托国家超级计算无锡中心强大的异构算力基础,构建了NSCCWX 新药研发平台。该平台结合了太湖之光 A+ 超算平台的卓越计算能力,以及高效的软件和数据资源,形成了完整的创新研发环境。平台包含基于物理学原理的层级虚拟筛选策略(SW - DOCK)、自研的SWBind AI大模型,以及包含约80亿分子的超大规模虚拟化合物库,涵盖公共和自建数据库。
SWBind是神威数智在依托国家超级计算无锡中心“太湖之光A+”智能超算系统提供的强大计算资源支持上,基于生物计算方向上的最新工作,很荣幸与大家分享现阶段性的成果。SWBind团队秉持着开放与合作的精神,已经将该模型的试用版本发布,诚挚欢迎各科研机构的专家学者、企事业单位的研发人员前来试用反馈,共同推动AI生物计算领域迈向新的辉煌。