典型案例

基于受体库的虚拟药物筛选:超大规模分子对接软件研制

药物性能不仅取决于药效，而是依赖于药效和毒副作用等指标的平衡。目前，评估化合物与特定受体结合能力的研究手段比较完善，但是充分评估药物分子与各种蛋白质的结合能力还面临很大的困难。在毒副作用研究方面尚未具备理性设计能力，只能通过昂贵的动物实验进行评估。在投资巨大的临床研究阶段，大批候选药物因为毒副作用而退出临床，带来巨额损失。评估药物与数千个受体的结合能力，目前无法通过实验研究实现。分子对接(DOCK) 是研究小分子与蛋白质相互作用的常用工具之一，被广泛用于快速评估小分子与受体的结合能力。

本项目设计了兼容UCSF  DOCK3格式输入的自研分子对接软件SWDOCK。支持神威•太湖之光和新一代神威超级计算机。在测试中可以达到平均每个受体在单核组上0.0075s的对接速度。并且具有良好的并行扩展性。